Le monde de la magie étant principalement originaire de Londres, toutes les personnes disposants de races et de pouvoirs issu de la zone magique, et leurs descendants, sont soumis à l'autorité de la Cour Suprême, hauts dirigeants de la magistrature magique. Le but de la Cour Suprême est d'assurer une dissimulation complète de la magie aux yeux des humains afin d'éviter tout possible incident. Elle est dirigée par Malicia Anatolie depuis 1885. Malicia elle-même travaille avec l'Escadron Fenrir de la brigade magique.

Seconde autorité de la magistrature, les hauts juges président aux cas de crises majeures, aux jugements de classes L et aux affaires magiques internationales. Ils sont aussi habilités à prendre en main les problèmes qui échappent à l'expertise de la cour inférieure. Les hauts juges sont au nombre de trois : Rowan Harrel, Megan Owen et Ayesha Bruce. Ils travaillent en collaboration avec l'Escadron Dragon.

La Cour Inférieure gère les affaires de Londres, les crimes magiques et les crises mineures ne nécessitant pas l'implication de la Cour Suprême. Ce sont eux, par exemple, qui s'occupent des incidents risquant de révéler la magie à petite échelle, des homicides ou autres délits impliquant l'utilisation d'un pouvoir et de la création d'identités fictives pour les personnes issus d'autres mondes ou les immortels.

La Cour Inférieure est divisée en plusieurs rangs. Les hauts magistrats, au nombre de cinq, qui président aux tribunaux de crises et rendent les verdicts, et qui sont aussi en contact direct avec la Cour Suprême. Dorian MacKenzie, actuel directeur de S'Indarë, comptait dans leurs rangs avant d'être affecté à l'école. En cas d'affaire pouvant impliquer les deux cours, ils servent d'intermédiaire.

Les magistrats, également cinq, gèrent les affaires de moindre importance ainsi que toutes les questions administratives liées aux apparitions, transformations et autres circonstances magiques pouvant créer des incidents. Ils travaillent en collaboration avec l'Escadron Centaure. Les simples juges et les avocats participent aux mêmes affaires, à raison de cinq juges par magistrat, afin d'éviter les jugements arbitraires. Ce sont aussi eux qui sont le plus souvent en contact avec l'Escadron Cerbère.

En plus des Cours de la magistrature, la gestion de la magie comporte sa propre brigade au sein des forces de l'ordre, et une branche scientifique divisée en deux sections.
→ Accéder à l'organigrame

La Cour Suprême gère les affaires d'envergure nationale ou internationale. Si Malicia n'intervient que rarement dans les décision de justice, à moins de cas extrêmement dangereux, c'est à la Cour Suprême que sont gérées tous les crimes impliquant des pouvoirs de classe L, à Londres ou ailleurs, et la décision de Malicia vaudra parole finale en cas de conflit au sein des hauts juges. En cas de crise mettant en danger le secret de la magie, c'est la Cour Suprême qui prendra les commandes : elle est habilitée à prendre toutes les décisions, même les plus extrêmes, pour parer à une urgence internationale. Cela inclut : isoler tous les non-humains, fermer les accès à la cité cachée, fermer la zone magique, intervenir dans un conflit à grande envergure, entre autres. Toute décision de la Cour Suprême a valeur de loi pour la communauté magique.

La Cour Suprême est également l'autorité supérieure géérant dans l'ombre tous les établissements d'apprentissage magique (S'Indarë en tête au vu de sa situation spécifique), les prisons souterraines et les établissements de soins pour non-humains. Ils ont de nombreux infiltrés dans le gouvernement anglais notamment, mais aussi à l'international, afin de gérer les potentiels problèmes depuis un statut reconnu officiellement par la loi humaine sans avoir à mettre leur secret en péril. En plus des hauts juges présidant à la justice magique, ils disposent donc de nombreux agents de niveau variés chargés de la gestion des crises magiques majeures.

Création d'identité : Parfois, il arrive que l'école doivent créer des nouvelles identités. Que ce soit parce qu'une personne a surgi d'un autre monde, ou quelqu'un qui s'est retrouvé transporté dans le temps, ou encore quelqu'un qui serait officiellement mort au nom de l'administration du pays, tout le monde n'est pas forcément né sur la bonne planète ni à la bonne époque pour avoir des papiers en règles selon la société britannique. Dans ces cas-là, le plus souvent, l'école recueille la personne dans le programme Black Sheep et la Cour Inférieure se charge de créer de faux justificatifs : acte de naissance, carte d'identité, etc. Cela permet de dissimuler l'apparition de personnes qui n'existaient pas jusque là, et a été grandement facilité par l'informatisation des données. Lorsque l'école ne recueille pas ces personnes, elles sont le plus souvent aidées par la police magique qui suit le même procédé. On use aussi de cette méthodes pour les personnes ayant dépassé l'âge "moyen" d'un être humain, en leur créant un enfant de toute pièce, portant le même nom, pour justifier leur âge. Jusque là, ce procédé a fonctionné, et il existe de nombreuses identités fictives dans les dossiers de l'administration britannique.

Crimes magiques : Tous les crimes impliquant des créatures non-humaines sont aussitôt pris en charge par la brigade magique de Londres. Ils court-circuitent tous les appels à la police, internes ou civils, afin d'être sûr d'arriver les premiers sur les lieux. Quand ce n'est pas le cas, ils envoient un escadron disposant d'un effaceur ou altérateur de mémoire, pour détourner la police humaine et l'empêcher de découvrir l'existence de la magie. Les crimes magiques sont jugés par la Cour Inférieure de la magistrature, ou par la Cour Suprême en cas d'incident grace ou de pouvoir de classe L. Les infractions aux lois spécifiques de la communauté magique conduisent généralement à des peines plus graves que des crimes "classiques" commis par des non-humains, car elles sont généralement considérées comme métant en danger la survie d'autrui ou de la communauté (plus d'infos sur les lois magiques dans l'annexe sur la brigade).

Incidents généralisés : Quand on met de la magie entre les mains d'adolescents, et parfois d'enfants, il arrive que des incidents de grande ampleur risquent d'exposer totalement son existence. Dans ce genre de cas, la Cour Suprême peut prendre toutes les décisions, aussi radicales soient-elles, jusqu'à ce que la crise soit résolue. Si l'incident touche uniquement la ville de Londres, la totalité des réseaux pouvant sortir de la ville est bloquée, ne laissant qu'une communication interne, afin d'éviter de répandre l'information. Ensuite de quoi la magistrature et la brigade s'occupent de chercher la ou les personnes responsables de l'incident, tout en trouvant une manière d'effacer les preuves du mieux possible. Cette manière varie selon les situations. Les incidents de grande envergure s'étant multipliés ces derniers temps (voir events), la Cour Suprême prend des mesures de plus en plus radicales pour gérer ces incidents.